三人出现在一个莫名其妙的房子里。“这里什么地方？”克罗诺问道。“大臣没追来吧。”玛尔还惊魂未定。“看来这里的文明很发达呢。”露卡道。“可别到了外星球。”玛尔道。

　　三人出了房子，只见天空灰暗，风雪呼啸，满目苍荑……由南边的半球体中的人指点，通过北方的16号废墟，到达阿利斯圆顶屋。其中的老人多恩告诉大家地下室中有食物和种子，还有一个能察出时空门的记录器，但由于机器故障，地下室中的保卫系统使他们无法进入，于是三人就下了地下室。在一间房间里，巨大的机器卫士出现了，这个大家伙有两个副机，建议先消灭一个，因为都消灭的话它会再生，必要时用二人技“回旋圣光”进行全体回复。获胜后，到存放食物的房间，调查后回到来时的铁架上。这时要抓一只老鼠，按B加速，按A捕捉，如失败可来回几次。抓到后它告诉了开通道路的方法是在控制器前同时按L和R键不放再按A键。照它说的到刚入地下室的地方，在右边的控制器前用此法，果然道路通了。进门后，通过绕来绕去的路，到了一个有记录仪的房间。露卡使用机器，发现东面的普罗美提半球体有一个时空门。玛尔也按了一个开关，屏幕上出现了公元1999年“拉沃斯日”的记录。目睹把美丽、文明的世界变成废墟的怪物，大家震惊了。

　　“拉……拉沃斯，世界会受到这样的灾难？”露卡喃喃道。“这难道就是我们的未来？太残酷了！”玛尔叫道。过了一会儿，玛尔说道：“这个未来，我们一定要改变它！怎么样，克罗诺，露卡？”露卡也说：“我们可以用时空门来做到，是吧，克罗诺？”

　　克罗诺当然同意，于是三人决定回到现代去进行预防工作，由于来时的时空门已经被封，所以只能去普罗米圆顶屋。回到地面，多恩谢过后告诉大家走32号废墟，但有个怪机器人……

　　出了阿利斯，建议先到南面的地下水道迹去，那里有些好装备。在地下水道迹，要注意①不要漏了墙后的路；②将红色的开关拨成绿色；③不要太好奇。在出口附近，会遇到怪物库罗里，它的拿手绝活是把人打得体力只剩1点(如本来就是1点，则不减体力)，所以要合理回复。出口处左有一开关，可以把桥接通，以后来往就方便多了。出来后可以到达死山和监视者的圆顶屋，现在没什么必要去，还是去32号废墟吧。

　　32号废墟中停着一辆漂亮的跑车，克罗诺刚碰一下就出来几个卫兵，正待开战，一个会变形的机器人乔尼出现了。乔尼一定要与克罗诺赛车，克罗诺接受了挑战，这样，就能欣赏到动感十足的赛车画面了。在赛车时，当右下角能量加满后按B可加速，不过只能用三次。如果获胜，可直接通过32号废墟，输了就只能打过去了。

　　终于到了普罗米，在那里见到了一个损坏的机器人，露卡发挥他的天才修好了它，由于原名R66-Y型叫着太别扭，克罗诺起名叫罗博。大家说明了来意，但有时空门的房间的门由于电力系统的故障而打不开，罗博认为可以到北面的工场启动非常电源，这时玛尔和露卡之间必须选择一个留下，建议把露卡留下。

　　三人来到工场，罗博关闭了激光栅栏。走进去，可以看见两个电梯，左边的通向研究所，右边的通向工场。工场中道路复杂，又有多种麻烦的开关装置，笔者第一次玩在这里陷了一个多小时，不过能找到不少好的装备，而且在这里才能找到开研究所大门的密码。在研究所最下层的房间中，启动门边上的电脑，听到“叮咚”一声后依次按XABY四键，门就能打开了。进了门，看到房间中部有一个开关，按动开关后，突然警铃大作，原来一个电脑精灵的封锁被打开，逃了出去。

　　这时，一切电器都失灵了，电梯已不能使用，只好用楼梯。在一个房间里，罗博被六个同类型的机器人打坏，两人将罗博运回了普罗米。露卡修好它后，大家打开了门，进入了时空门……

　　这次到了一个更为奇怪的地方，那儿的老人告诉大家这里是时光终点，就是时间的尽头，是由于时间隧道中出现了四个人而产生了超载，所以来到了这里。

　　这时得留下一个人在时光终点，以后在移动画面中按Y键可随时换人。在老人的指引下，大家到右上方的一个小房间，里面有一个自称战神的家伙，它要求克罗诺一行顺时针绕栅栏跑三圈，照办后大家就能用魔法了！不过只有在状态栏的头像边有字的才能用(如克罗诺为“天”，露卡为“火”)，所以每个能用魔法的伙伴包括以后加入的都应该见见这们位战神。之后可以与战神战斗，如获胜有很大好处。现在到左上的平台，在光柱中按A就能进行时间旅行了，这时应该去A.C.1000年的梅迪那村。

　　在一个柜子里，三人走了出来。只见两个小魔族正在吃饭，原来这个村子里四百年前人魔大战后魔族聚居的地方。在好心的小魔族的指引下，三人来到村西。可以先去小屋拜访兵器制造家博修，买些装备，再去北面的黑克兰山洞。

　　洞中有不少视人类为死敌的魔族，对付它们大都要用新学的魔法才有效。通过弯弯曲曲的道路，淌过浅滩，终于见到大恶魔海克兰了。

　　用物理攻击效果不大，最好用魔法，在它进入反击状态时不要攻击(它也不会攻击)，战胜它并不困难。海克兰在临死时说拉沃斯是魔族之神，于是克罗诺认为该去中世打倒魔王，消灭拉沃斯，就能改变未来了。再向上走，通过海底水流，三人到了露卡家的附近，去探望一下克罗诺的母亲吧。

　　从千年祭会场的时空门到了时光终点，再“换车”前往A.D.600年的中世。

　　到修道院南的萨南桥，听了骑士团长的话，三人来到嘉鲁帝亚王城中的厨房要超级肉，但不管是找厨师长还是在桌前点菜都没有用，只好悻悻而去时，却被厨师长叫住，原来他也有热心的一面呀。

　　克罗诺回到塞南桥，只见两名骑士已经受了伤，将厨师长给的肉交给骑士团长。团长准备以死殉国，正在交待后事时，忽闻魔王军来了，克罗诺要帮助骑士团，便向桥中跑去……

　　桥上会遇到魔王的三大变态部下之一的比内加，这个家伙不断使唤骷髅想阻止克罗诺，但没什么用。一直到了桥头，比内加招唤出一个合体怪物，只要用非天系的攻击(如果用天系的技反而会使敌HP回复)，再注意回复便不难获胜。

　　过了桥来到圣特利诺村，在村长家，可以见到冒险家托马也在那儿，正接受委托去找虹色贝。再去旅馆，跟据托马的话，前往南面的森林，在最里面的一堆草中探索，可以找到青蛙居住的小屋。

　　克罗诺将打倒魔王的想法告诉了青蛙，但他认为不可能，除非有传说的神剑格兰利昂。